麻薬取締官は、厚生労働省の地方支分部局である地方厚生（支）局に設置されている麻薬取締部に所属し、刑事訴訟法に基づく特別司法警察職員としての権限を持っています。

医薬品である麻薬や向精神薬の流通経路を監視するため、定期的に病院、薬局、製薬会社等に立入検査に入っています。正規流通経路からの横流しや不正使用を防止するための指導と助言が行われています。